Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE6

SPAG4, Sperm-associated antigen 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG4Q9NPE6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPAG4Q9NPE6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPAG4Q9NPE6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPAG4Q9NPE6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPAG4Q9NPE6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPAG4Q9NPE6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPAG4Q9NPE6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPAG4Q9NPE6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPAG4Q9NPE6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPAG4Q9NPE6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG4Q9NPE6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG4Q9NPE6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG4Q9NPE6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG4Q9NPE6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPAG4Q9NPE6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms