Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
GPCPD1Q9NPB8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GPCPD1Q9NPB8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GPCPD1Q9NPB8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GPCPD1Q9NPB8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GPCPD1Q9NPB8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GPCPD1Q9NPB8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GPCPD1Q9NPB8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GPCPD1Q9NPB8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPCPD1Q9NPB8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GPCPD1Q9NPB8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms