Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRM3Q9NNZ6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRM3Q9NNZ6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRM3Q9NNZ6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms