Protein–RNA interactions for Protein: Q9N2J8

HERV-H_2q24.1 provirus ancestral Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9N2J8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9N2J8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9N2J8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9N2J8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9N2J8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9N2J8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9N2J8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9N2J8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9N2J8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9N2J8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9N2J8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9N2J8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9N2J8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9N2J8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9N2J8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9N2J8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9N2J8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9N2J8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9N2J8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9N2J8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9N2J8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9N2J8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9N2J8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9N2J8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9N2J8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9N2J8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9N2J8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9N2J8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9N2J8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9N2J8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9N2J8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9N2J8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9N2J8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9N2J8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9N2J8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9N2J8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9N2J8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9N2J8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9N2J8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9N2J8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9N2J8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9N2J8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9N2J8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9N2J8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9N2J8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9N2J8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9N2J8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9N2J8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9N2J8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9N2J8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9N2J8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9N2J8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9N2J8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9N2J8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9N2J8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9N2J8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9N2J8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9N2J8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9N2J8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9N2J8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9N2J8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9N2J8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9N2J8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9N2J8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9N2J8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9N2J8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9N2J8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9N2J8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9N2J8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9N2J8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9N2J8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9N2J8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9N2J8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9N2J8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9N2J8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9N2J8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9N2J8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9N2J8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9N2J8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9N2J8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9N2J8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9N2J8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9N2J8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9N2J8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9N2J8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9N2J8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9N2J8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9N2J8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9N2J8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9N2J8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9N2J8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9N2J8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9N2J8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q9N2J8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9N2J8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9N2J8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9N2J8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9N2J8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9N2J8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9N2J8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms