Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBL6

LRTM1, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRTM1Q9HBL6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRTM1Q9HBL6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRTM1Q9HBL6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRTM1Q9HBL6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRTM1Q9HBL6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRTM1Q9HBL6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRTM1Q9HBL6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRTM1Q9HBL6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRTM1Q9HBL6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRTM1Q9HBL6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRTM1Q9HBL6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRTM1Q9HBL6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRTM1Q9HBL6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRTM1Q9HBL6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRTM1Q9HBL6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRTM1Q9HBL6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRTM1Q9HBL6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRTM1Q9HBL6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRTM1Q9HBL6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRTM1Q9HBL6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRTM1Q9HBL6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRTM1Q9HBL6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRTM1Q9HBL6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRTM1Q9HBL6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRTM1Q9HBL6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRTM1Q9HBL6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRTM1Q9HBL6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRTM1Q9HBL6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRTM1Q9HBL6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRTM1Q9HBL6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRTM1Q9HBL6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRTM1Q9HBL6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRTM1Q9HBL6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRTM1Q9HBL6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRTM1Q9HBL6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRTM1Q9HBL6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRTM1Q9HBL6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRTM1Q9HBL6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRTM1Q9HBL6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRTM1Q9HBL6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRTM1Q9HBL6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRTM1Q9HBL6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRTM1Q9HBL6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRTM1Q9HBL6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRTM1Q9HBL6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRTM1Q9HBL6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRTM1Q9HBL6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRTM1Q9HBL6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRTM1Q9HBL6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRTM1Q9HBL6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRTM1Q9HBL6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRTM1Q9HBL6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRTM1Q9HBL6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRTM1Q9HBL6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRTM1Q9HBL6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRTM1Q9HBL6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRTM1Q9HBL6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRTM1Q9HBL6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRTM1Q9HBL6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms