Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NRDE2Q9H7Z3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NRDE2Q9H7Z3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NRDE2Q9H7Z3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NRDE2Q9H7Z3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms