Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
C5orf42Q9H799 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
C5orf42Q9H799 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C5orf42Q9H799 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms