Protein–RNA interactions for Protein: Q9H788

SH2D4A, SH2 domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4AQ9H788 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SH2D4AQ9H788 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SH2D4AQ9H788 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SH2D4AQ9H788 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SH2D4AQ9H788 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SH2D4AQ9H788 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SH2D4AQ9H788 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SH2D4AQ9H788 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SH2D4AQ9H788 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SH2D4AQ9H788 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SH2D4AQ9H788 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SH2D4AQ9H788 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SH2D4AQ9H788 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SH2D4AQ9H788 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SH2D4AQ9H788 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SH2D4AQ9H788 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SH2D4AQ9H788 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SH2D4AQ9H788 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SH2D4AQ9H788 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SH2D4AQ9H788 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SH2D4AQ9H788 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SH2D4AQ9H788 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SH2D4AQ9H788 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SH2D4AQ9H788 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SH2D4AQ9H788 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SH2D4AQ9H788 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SH2D4AQ9H788 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SH2D4AQ9H788 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SH2D4AQ9H788 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SH2D4AQ9H788 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SH2D4AQ9H788 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SH2D4AQ9H788 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SH2D4AQ9H788 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SH2D4AQ9H788 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SH2D4AQ9H788 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms