Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRABDQ9H4I3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRABDQ9H4I3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRABDQ9H4I3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms