Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TNMDQ9H2S6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TNMDQ9H2S6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TNMDQ9H2S6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms