Protein–RNA interactions for Protein: Q9H159

CDH19, Cadherin-19, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH19Q9H159 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH19Q9H159 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH19Q9H159 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH19Q9H159 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms