Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Y0

ATG10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG10Q9H0Y0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG10Q9H0Y0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG10Q9H0Y0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG10Q9H0Y0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG10Q9H0Y0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG10Q9H0Y0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG10Q9H0Y0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG10Q9H0Y0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG10Q9H0Y0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG10Q9H0Y0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG10Q9H0Y0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG10Q9H0Y0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG10Q9H0Y0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG10Q9H0Y0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG10Q9H0Y0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG10Q9H0Y0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG10Q9H0Y0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG10Q9H0Y0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG10Q9H0Y0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG10Q9H0Y0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG10Q9H0Y0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG10Q9H0Y0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG10Q9H0Y0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG10Q9H0Y0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG10Q9H0Y0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG10Q9H0Y0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG10Q9H0Y0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG10Q9H0Y0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG10Q9H0Y0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATG10Q9H0Y0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG10Q9H0Y0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG10Q9H0Y0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG10Q9H0Y0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG10Q9H0Y0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATG10Q9H0Y0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG10Q9H0Y0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG10Q9H0Y0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG10Q9H0Y0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG10Q9H0Y0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATG10Q9H0Y0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG10Q9H0Y0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG10Q9H0Y0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG10Q9H0Y0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG10Q9H0Y0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG10Q9H0Y0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG10Q9H0Y0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG10Q9H0Y0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATG10Q9H0Y0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG10Q9H0Y0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG10Q9H0Y0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG10Q9H0Y0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG10Q9H0Y0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG10Q9H0Y0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATG10Q9H0Y0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG10Q9H0Y0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATG10Q9H0Y0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms