Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

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Length 712 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
USP44Q9H0E7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
USP44Q9H0E7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
USP44Q9H0E7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP44Q9H0E7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP44Q9H0E7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP44Q9H0E7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP44Q9H0E7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP44Q9H0E7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP44Q9H0E7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
USP44Q9H0E7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
USP44Q9H0E7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
USP44Q9H0E7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
USP44Q9H0E7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP44Q9H0E7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP44Q9H0E7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
USP44Q9H0E7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP44Q9H0E7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP44Q9H0E7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
USP44Q9H0E7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP44Q9H0E7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP44Q9H0E7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP44Q9H0E7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP44Q9H0E7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP44Q9H0E7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP44Q9H0E7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP44Q9H0E7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP44Q9H0E7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP44Q9H0E7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
USP44Q9H0E7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
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