Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD1Q9GZZ0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXD1Q9GZZ0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXD1Q9GZZ0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HOXD1Q9GZZ0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms