Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NLRP1Q9C000 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NLRP1Q9C000 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NLRP1Q9C000 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NLRP1Q9C000 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NLRP1Q9C000 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NLRP1Q9C000 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NLRP1Q9C000 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NLRP1Q9C000 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NLRP1Q9C000 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NLRP1Q9C000 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NLRP1Q9C000 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NLRP1Q9C000 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
NLRP1Q9C000 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
NLRP1Q9C000 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NLRP1Q9C000 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
NLRP1Q9C000 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
NLRP1Q9C000 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
NLRP1Q9C000 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
NLRP1Q9C000 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
NLRP1Q9C000 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NLRP1Q9C000 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NLRP1Q9C000 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NLRP1Q9C000 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NLRP1Q9C000 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NLRP1Q9C000 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NLRP1Q9C000 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NLRP1Q9C000 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
NLRP1Q9C000 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NLRP1Q9C000 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
NLRP1Q9C000 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
NLRP1Q9C000 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NLRP1Q9C000 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NLRP1Q9C000 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
NLRP1Q9C000 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NLRP1Q9C000 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NLRP1Q9C000 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NLRP1Q9C000 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NLRP1Q9C000 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
NLRP1Q9C000 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
NLRP1Q9C000 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NLRP1Q9C000 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
NLRP1Q9C000 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NLRP1Q9C000 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NLRP1Q9C000 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
NLRP1Q9C000 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NLRP1Q9C000 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NLRP1Q9C000 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
NLRP1Q9C000 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NLRP1Q9C000 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NLRP1Q9C000 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NLRP1Q9C000 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NLRP1Q9C000 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NLRP1Q9C000 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NLRP1Q9C000 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NLRP1Q9C000 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NLRP1Q9C000 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NLRP1Q9C000 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NLRP1Q9C000 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
NLRP1Q9C000 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NLRP1Q9C000 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
NLRP1Q9C000 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NLRP1Q9C000 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NLRP1Q9C000 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NLRP1Q9C000 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NLRP1Q9C000 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NLRP1Q9C000 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
NLRP1Q9C000 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
NLRP1Q9C000 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NLRP1Q9C000 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NLRP1Q9C000 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
NLRP1Q9C000 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NLRP1Q9C000 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
NLRP1Q9C000 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NLRP1Q9C000 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NLRP1Q9C000 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
NLRP1Q9C000 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
NLRP1Q9C000 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NLRP1Q9C000 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
NLRP1Q9C000 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NLRP1Q9C000 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
NLRP1Q9C000 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NLRP1Q9C000 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NLRP1Q9C000 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NLRP1Q9C000 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NLRP1Q9C000 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NLRP1Q9C000 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NLRP1Q9C000 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NLRP1Q9C000 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NLRP1Q9C000 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NLRP1Q9C000 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
NLRP1Q9C000 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
NLRP1Q9C000 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
NLRP1Q9C000 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NLRP1Q9C000 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NLRP1Q9C000 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NLRP1Q9C000 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NLRP1Q9C000 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NLRP1Q9C000 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NLRP1Q9C000 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms