Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW4

TM6SF2, Transmembrane 6 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF2Q9BZW4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TM6SF2Q9BZW4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TM6SF2Q9BZW4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM6SF2Q9BZW4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms