Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FOXP3Q9BZS1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
FOXP3Q9BZS1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FOXP3Q9BZS1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms