Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM54Q9BYV2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM54Q9BYV2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM54Q9BYV2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM54Q9BYV2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRIM54Q9BYV2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM54Q9BYV2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM54Q9BYV2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM54Q9BYV2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM54Q9BYV2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM54Q9BYV2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRIM54Q9BYV2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM54Q9BYV2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM54Q9BYV2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM54Q9BYV2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM54Q9BYV2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM54Q9BYV2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM54Q9BYV2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM54Q9BYV2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM54Q9BYV2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM54Q9BYV2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM54Q9BYV2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM54Q9BYV2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM54Q9BYV2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM54Q9BYV2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM54Q9BYV2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM54Q9BYV2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM54Q9BYV2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM54Q9BYV2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM54Q9BYV2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM54Q9BYV2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM54Q9BYV2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM54Q9BYV2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM54Q9BYV2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM54Q9BYV2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM54Q9BYV2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM54Q9BYV2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM54Q9BYV2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM54Q9BYV2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM54Q9BYV2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM54Q9BYV2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM54Q9BYV2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM54Q9BYV2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM54Q9BYV2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM54Q9BYV2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM54Q9BYV2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM54Q9BYV2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM54Q9BYV2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM54Q9BYV2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM54Q9BYV2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM54Q9BYV2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM54Q9BYV2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM54Q9BYV2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM54Q9BYV2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM54Q9BYV2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM54Q9BYV2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM54Q9BYV2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM54Q9BYV2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM54Q9BYV2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM54Q9BYV2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM54Q9BYV2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms