Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACTRT3Q9BYD9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACTRT3Q9BYD9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACTRT3Q9BYD9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTRT3Q9BYD9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTRT3Q9BYD9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTRT3Q9BYD9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTRT3Q9BYD9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACTRT3Q9BYD9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTRT3Q9BYD9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTRT3Q9BYD9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTRT3Q9BYD9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTRT3Q9BYD9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTRT3Q9BYD9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACTRT3Q9BYD9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms