Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD1Q9BXT4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD1Q9BXT4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TDRD1Q9BXT4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TDRD1Q9BXT4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TDRD1Q9BXT4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD1Q9BXT4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD1Q9BXT4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD1Q9BXT4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD1Q9BXT4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TDRD1Q9BXT4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD1Q9BXT4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD1Q9BXT4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TDRD1Q9BXT4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD1Q9BXT4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD1Q9BXT4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD1Q9BXT4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD1Q9BXT4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD1Q9BXT4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD1Q9BXT4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD1Q9BXT4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TDRD1Q9BXT4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD1Q9BXT4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD1Q9BXT4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD1Q9BXT4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD1Q9BXT4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TDRD1Q9BXT4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDRD1Q9BXT4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TDRD1Q9BXT4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TDRD1Q9BXT4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDRD1Q9BXT4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDRD1Q9BXT4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDRD1Q9BXT4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDRD1Q9BXT4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDRD1Q9BXT4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDRD1Q9BXT4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDRD1Q9BXT4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TDRD1Q9BXT4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TDRD1Q9BXT4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms