Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB1

LGR4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR4Q9BXB1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LGR4Q9BXB1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LGR4Q9BXB1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms