Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX95

SGPP1, Sphingosine-1-phosphate phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGPP1Q9BX95 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGPP1Q9BX95 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGPP1Q9BX95 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGPP1Q9BX95 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGPP1Q9BX95 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGPP1Q9BX95 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGPP1Q9BX95 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGPP1Q9BX95 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SGPP1Q9BX95 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGPP1Q9BX95 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SGPP1Q9BX95 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SGPP1Q9BX95 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGPP1Q9BX95 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGPP1Q9BX95 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SGPP1Q9BX95 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGPP1Q9BX95 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SGPP1Q9BX95 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGPP1Q9BX95 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGPP1Q9BX95 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGPP1Q9BX95 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGPP1Q9BX95 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGPP1Q9BX95 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGPP1Q9BX95 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGPP1Q9BX95 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGPP1Q9BX95 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGPP1Q9BX95 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGPP1Q9BX95 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SGPP1Q9BX95 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGPP1Q9BX95 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGPP1Q9BX95 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGPP1Q9BX95 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGPP1Q9BX95 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGPP1Q9BX95 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SGPP1Q9BX95 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGPP1Q9BX95 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGPP1Q9BX95 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGPP1Q9BX95 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGPP1Q9BX95 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGPP1Q9BX95 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGPP1Q9BX95 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGPP1Q9BX95 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGPP1Q9BX95 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGPP1Q9BX95 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGPP1Q9BX95 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms