Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C9orf16Q9BUW7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C9orf16Q9BUW7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C9orf16Q9BUW7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms