Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUD6

SPON2, Spondin-2, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPON2Q9BUD6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPON2Q9BUD6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPON2Q9BUD6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPON2Q9BUD6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPON2Q9BUD6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SPON2Q9BUD6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPON2Q9BUD6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPON2Q9BUD6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPON2Q9BUD6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPON2Q9BUD6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPON2Q9BUD6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SPON2Q9BUD6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPON2Q9BUD6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPON2Q9BUD6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPON2Q9BUD6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPON2Q9BUD6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPON2Q9BUD6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPON2Q9BUD6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPON2Q9BUD6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPON2Q9BUD6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPON2Q9BUD6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPON2Q9BUD6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPON2Q9BUD6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPON2Q9BUD6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPON2Q9BUD6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms