Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SIKE1Q9BRV8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SIKE1Q9BRV8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SIKE1Q9BRV8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms