Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RIOK1Q9BRS2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RIOK1Q9BRS2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
RIOK1Q9BRS2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RIOK1Q9BRS2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RIOK1Q9BRS2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RIOK1Q9BRS2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RIOK1Q9BRS2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RIOK1Q9BRS2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RIOK1Q9BRS2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RIOK1Q9BRS2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RIOK1Q9BRS2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RIOK1Q9BRS2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RIOK1Q9BRS2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RIOK1Q9BRS2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RIOK1Q9BRS2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RIOK1Q9BRS2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RIOK1Q9BRS2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RIOK1Q9BRS2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RIOK1Q9BRS2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RIOK1Q9BRS2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RIOK1Q9BRS2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RIOK1Q9BRS2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RIOK1Q9BRS2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RIOK1Q9BRS2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RIOK1Q9BRS2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RIOK1Q9BRS2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RIOK1Q9BRS2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms