Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRR0

ZKSCAN3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN3Q9BRR0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ZKSCAN3Q9BRR0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZKSCAN3Q9BRR0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZKSCAN3Q9BRR0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZKSCAN3Q9BRR0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ZKSCAN3Q9BRR0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZKSCAN3Q9BRR0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZKSCAN3Q9BRR0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZKSCAN3Q9BRR0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZKSCAN3Q9BRR0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZKSCAN3Q9BRR0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ZKSCAN3Q9BRR0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZKSCAN3Q9BRR0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZKSCAN3Q9BRR0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZKSCAN3Q9BRR0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ZKSCAN3Q9BRR0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ZKSCAN3Q9BRR0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZKSCAN3Q9BRR0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZKSCAN3Q9BRR0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZKSCAN3Q9BRR0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZKSCAN3Q9BRR0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZKSCAN3Q9BRR0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ZKSCAN3Q9BRR0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZKSCAN3Q9BRR0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ZKSCAN3Q9BRR0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZKSCAN3Q9BRR0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZKSCAN3Q9BRR0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZKSCAN3Q9BRR0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ZKSCAN3Q9BRR0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ZKSCAN3Q9BRR0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZKSCAN3Q9BRR0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ZKSCAN3Q9BRR0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms