Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SRSF8Q9BRL6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SRSF8Q9BRL6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SRSF8Q9BRL6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms