Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZSWIM1Q9BR11 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZSWIM1Q9BR11 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZSWIM1Q9BR11 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZSWIM1Q9BR11 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZSWIM1Q9BR11 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ZSWIM1Q9BR11 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZSWIM1Q9BR11 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZSWIM1Q9BR11 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZSWIM1Q9BR11 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZSWIM1Q9BR11 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZSWIM1Q9BR11 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZSWIM1Q9BR11 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZSWIM1Q9BR11 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZSWIM1Q9BR11 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZSWIM1Q9BR11 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZSWIM1Q9BR11 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZSWIM1Q9BR11 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZSWIM1Q9BR11 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZSWIM1Q9BR11 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZSWIM1Q9BR11 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZSWIM1Q9BR11 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZSWIM1Q9BR11 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZSWIM1Q9BR11 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZSWIM1Q9BR11 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZSWIM1Q9BR11 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZSWIM1Q9BR11 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZSWIM1Q9BR11 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ZSWIM1Q9BR11 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZSWIM1Q9BR11 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZSWIM1Q9BR11 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZSWIM1Q9BR11 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZSWIM1Q9BR11 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZSWIM1Q9BR11 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZSWIM1Q9BR11 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZSWIM1Q9BR11 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZSWIM1Q9BR11 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZSWIM1Q9BR11 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZSWIM1Q9BR11 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZSWIM1Q9BR11 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZSWIM1Q9BR11 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZSWIM1Q9BR11 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZSWIM1Q9BR11 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZSWIM1Q9BR11 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZSWIM1Q9BR11 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZSWIM1Q9BR11 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZSWIM1Q9BR11 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZSWIM1Q9BR11 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZSWIM1Q9BR11 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZSWIM1Q9BR11 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZSWIM1Q9BR11 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZSWIM1Q9BR11 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZSWIM1Q9BR11 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZSWIM1Q9BR11 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZSWIM1Q9BR11 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZSWIM1Q9BR11 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZSWIM1Q9BR11 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZSWIM1Q9BR11 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms