Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DUSP9Q99956 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DUSP9Q99956 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DUSP9Q99956 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DUSP9Q99956 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DUSP9Q99956 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DUSP9Q99956 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DUSP9Q99956 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DUSP9Q99956 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DUSP9Q99956 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DUSP9Q99956 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DUSP9Q99956 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DUSP9Q99956 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DUSP9Q99956 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DUSP9Q99956 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DUSP9Q99956 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DUSP9Q99956 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DUSP9Q99956 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DUSP9Q99956 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DUSP9Q99956 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DUSP9Q99956 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DUSP9Q99956 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DUSP9Q99956 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUSP9Q99956 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUSP9Q99956 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUSP9Q99956 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUSP9Q99956 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUSP9Q99956 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUSP9Q99956 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUSP9Q99956 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUSP9Q99956 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DUSP9Q99956 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms