Protein–RNA interactions for Protein: Q99828

CIB1, Calcium and integrin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIB1Q99828 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIB1Q99828 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CIB1Q99828 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CIB1Q99828 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms