Protein–RNA interactions for Protein: Q99728

BARD1, BRCA1-associated RING domain protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARD1Q99728 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BARD1Q99728 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BARD1Q99728 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BARD1Q99728 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms