Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UHRF1Q96T88 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UHRF1Q96T88 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UHRF1Q96T88 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UHRF1Q96T88 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UHRF1Q96T88 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UHRF1Q96T88 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UHRF1Q96T88 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UHRF1Q96T88 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UHRF1Q96T88 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UHRF1Q96T88 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UHRF1Q96T88 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UHRF1Q96T88 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UHRF1Q96T88 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UHRF1Q96T88 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UHRF1Q96T88 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UHRF1Q96T88 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UHRF1Q96T88 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UHRF1Q96T88 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UHRF1Q96T88 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UHRF1Q96T88 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UHRF1Q96T88 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UHRF1Q96T88 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UHRF1Q96T88 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
UHRF1Q96T88 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UHRF1Q96T88 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UHRF1Q96T88 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UHRF1Q96T88 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UHRF1Q96T88 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms