Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK5RAP2Q96SN8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK5RAP2Q96SN8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK5RAP2Q96SN8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK5RAP2Q96SN8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK5RAP2Q96SN8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK5RAP2Q96SN8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK5RAP2Q96SN8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK5RAP2Q96SN8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK5RAP2Q96SN8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK5RAP2Q96SN8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK5RAP2Q96SN8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK5RAP2Q96SN8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK5RAP2Q96SN8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDK5RAP2Q96SN8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK5RAP2Q96SN8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK5RAP2Q96SN8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK5RAP2Q96SN8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK5RAP2Q96SN8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK5RAP2Q96SN8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK5RAP2Q96SN8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK5RAP2Q96SN8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK5RAP2Q96SN8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK5RAP2Q96SN8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK5RAP2Q96SN8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK5RAP2Q96SN8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK5RAP2Q96SN8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK5RAP2Q96SN8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK5RAP2Q96SN8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK5RAP2Q96SN8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK5RAP2Q96SN8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK5RAP2Q96SN8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK5RAP2Q96SN8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK5RAP2Q96SN8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK5RAP2Q96SN8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CDK5RAP2Q96SN8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CDK5RAP2Q96SN8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDK5RAP2Q96SN8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDK5RAP2Q96SN8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK5RAP2Q96SN8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK5RAP2Q96SN8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK5RAP2Q96SN8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK5RAP2Q96SN8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK5RAP2Q96SN8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK5RAP2Q96SN8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK5RAP2Q96SN8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK5RAP2Q96SN8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK5RAP2Q96SN8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK5RAP2Q96SN8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK5RAP2Q96SN8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK5RAP2Q96SN8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK5RAP2Q96SN8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK5RAP2Q96SN8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK5RAP2Q96SN8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK5RAP2Q96SN8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK5RAP2Q96SN8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK5RAP2Q96SN8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK5RAP2Q96SN8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK5RAP2Q96SN8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK5RAP2Q96SN8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK5RAP2Q96SN8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK5RAP2Q96SN8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms