Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC115Q96NT0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC115Q96NT0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms