Protein–RNA interactions for Protein: Q96N03

VSTM2L, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2LQ96N03 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VSTM2LQ96N03 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSTM2LQ96N03 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSTM2LQ96N03 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms