Protein–RNA interactions for Protein: Q96L42

KCNH8, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH8Q96L42 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
KCNH8Q96L42 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
KCNH8Q96L42 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
KCNH8Q96L42 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
KCNH8Q96L42 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
KCNH8Q96L42 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
KCNH8Q96L42 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
KCNH8Q96L42 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
KCNH8Q96L42 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
KCNH8Q96L42 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
KCNH8Q96L42 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
KCNH8Q96L42 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
KCNH8Q96L42 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
KCNH8Q96L42 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
KCNH8Q96L42 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
KCNH8Q96L42 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
KCNH8Q96L42 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
KCNH8Q96L42 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
KCNH8Q96L42 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
KCNH8Q96L42 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
KCNH8Q96L42 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
KCNH8Q96L42 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
KCNH8Q96L42 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
KCNH8Q96L42 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
KCNH8Q96L42 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
KCNH8Q96L42 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
KCNH8Q96L42 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
KCNH8Q96L42 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
KCNH8Q96L42 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.61
KCNH8Q96L42 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
KCNH8Q96L42 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
KCNH8Q96L42 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
KCNH8Q96L42 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
KCNH8Q96L42 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
KCNH8Q96L42 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
KCNH8Q96L42 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
KCNH8Q96L42 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
KCNH8Q96L42 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
KCNH8Q96L42 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
KCNH8Q96L42 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
KCNH8Q96L42 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
KCNH8Q96L42 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
KCNH8Q96L42 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
KCNH8Q96L42 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
KCNH8Q96L42 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
KCNH8Q96L42 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
KCNH8Q96L42 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
KCNH8Q96L42 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
KCNH8Q96L42 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
KCNH8Q96L42 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
KCNH8Q96L42 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
KCNH8Q96L42 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
KCNH8Q96L42 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
KCNH8Q96L42 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
KCNH8Q96L42 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
KCNH8Q96L42 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
KCNH8Q96L42 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
KCNH8Q96L42 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
KCNH8Q96L42 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
KCNH8Q96L42 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
KCNH8Q96L42 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
KCNH8Q96L42 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
KCNH8Q96L42 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
KCNH8Q96L42 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
KCNH8Q96L42 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
KCNH8Q96L42 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
KCNH8Q96L42 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
KCNH8Q96L42 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
KCNH8Q96L42 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
KCNH8Q96L42 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
KCNH8Q96L42 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
KCNH8Q96L42 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
KCNH8Q96L42 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
KCNH8Q96L42 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
KCNH8Q96L42 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
KCNH8Q96L42 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
KCNH8Q96L42 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
KCNH8Q96L42 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
KCNH8Q96L42 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
KCNH8Q96L42 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
KCNH8Q96L42 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.43■■■■□ 3.58
KCNH8Q96L42 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.43■■■■□ 3.58
KCNH8Q96L42 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
KCNH8Q96L42 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
KCNH8Q96L42 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
KCNH8Q96L42 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
KCNH8Q96L42 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
KCNH8Q96L42 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
KCNH8Q96L42 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
KCNH8Q96L42 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
KCNH8Q96L42 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
KCNH8Q96L42 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
KCNH8Q96L42 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
KCNH8Q96L42 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
KCNH8Q96L42 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC37.4■■■■□ 3.58
KCNH8Q96L42 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
KCNH8Q96L42 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC37.39■■■■□ 3.58
KCNH8Q96L42 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
KCNH8Q96L42 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
KCNH8Q96L42 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms