Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM87BQ96K49 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM87BQ96K49 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM87BQ96K49 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMEM87BQ96K49 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM87BQ96K49 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM87BQ96K49 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMEM87BQ96K49 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TMEM87BQ96K49 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMEM87BQ96K49 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM87BQ96K49 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM87BQ96K49 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM87BQ96K49 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TMEM87BQ96K49 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM87BQ96K49 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM87BQ96K49 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM87BQ96K49 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM87BQ96K49 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM87BQ96K49 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM87BQ96K49 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM87BQ96K49 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMEM87BQ96K49 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM87BQ96K49 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM87BQ96K49 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM87BQ96K49 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM87BQ96K49 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMEM87BQ96K49 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMEM87BQ96K49 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM87BQ96K49 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM87BQ96K49 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM87BQ96K49 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM87BQ96K49 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM87BQ96K49 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM87BQ96K49 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM87BQ96K49 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMEM87BQ96K49 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMEM87BQ96K49 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMEM87BQ96K49 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMEM87BQ96K49 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMEM87BQ96K49 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms