Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK5RAP3Q96JB5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK5RAP3Q96JB5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK5RAP3Q96JB5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms