Protein–RNA interactions for Protein: Q96GC5

MRPL48, 39S ribosomal protein L48, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL48Q96GC5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRPL48Q96GC5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRPL48Q96GC5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRPL48Q96GC5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MRPL48Q96GC5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRPL48Q96GC5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRPL48Q96GC5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MRPL48Q96GC5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
MRPL48Q96GC5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MRPL48Q96GC5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MRPL48Q96GC5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms