Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IMP4Q96G21 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
IMP4Q96G21 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IMP4Q96G21 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IMP4Q96G21 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms