Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STAMBPL1Q96FJ0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STAMBPL1Q96FJ0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
STAMBPL1Q96FJ0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
STAMBPL1Q96FJ0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STAMBPL1Q96FJ0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms