Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RNFT2Q96EX2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RNFT2Q96EX2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNFT2Q96EX2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.9 ms