Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TVP23CQ96ET8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TVP23CQ96ET8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TVP23CQ96ET8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms