Protein–RNA interactions for Protein: Q96EA4

SPDL1, Protein Spindly, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDL1Q96EA4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SPDL1Q96EA4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPDL1Q96EA4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPDL1Q96EA4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms