Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM44Q96DX7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM44Q96DX7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM44Q96DX7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM44Q96DX7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms