Protein–RNA interactions for Protein: Q96DV4

MRPL38, 39S ribosomal protein L38, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL38Q96DV4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MRPL38Q96DV4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL38Q96DV4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPL38Q96DV4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL38Q96DV4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms