Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX6

LRRC58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC58Q96CX6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC58Q96CX6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC58Q96CX6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC58Q96CX6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC58Q96CX6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC58Q96CX6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC58Q96CX6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC58Q96CX6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC58Q96CX6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC58Q96CX6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC58Q96CX6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC58Q96CX6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC58Q96CX6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC58Q96CX6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC58Q96CX6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC58Q96CX6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC58Q96CX6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC58Q96CX6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC58Q96CX6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC58Q96CX6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC58Q96CX6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC58Q96CX6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC58Q96CX6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC58Q96CX6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC58Q96CX6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC58Q96CX6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC58Q96CX6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC58Q96CX6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC58Q96CX6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC58Q96CX6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC58Q96CX6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC58Q96CX6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC58Q96CX6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC58Q96CX6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC58Q96CX6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms