Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GCC1Q96CN9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GCC1Q96CN9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
GCC1Q96CN9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GCC1Q96CN9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GCC1Q96CN9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GCC1Q96CN9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GCC1Q96CN9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GCC1Q96CN9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
GCC1Q96CN9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GCC1Q96CN9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GCC1Q96CN9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
GCC1Q96CN9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GCC1Q96CN9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GCC1Q96CN9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GCC1Q96CN9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GCC1Q96CN9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GCC1Q96CN9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
GCC1Q96CN9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GCC1Q96CN9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GCC1Q96CN9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GCC1Q96CN9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
GCC1Q96CN9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GCC1Q96CN9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GCC1Q96CN9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GCC1Q96CN9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GCC1Q96CN9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
GCC1Q96CN9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
GCC1Q96CN9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GCC1Q96CN9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GCC1Q96CN9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
GCC1Q96CN9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GCC1Q96CN9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
GCC1Q96CN9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GCC1Q96CN9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GCC1Q96CN9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
GCC1Q96CN9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
GCC1Q96CN9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GCC1Q96CN9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GCC1Q96CN9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GCC1Q96CN9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GCC1Q96CN9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GCC1Q96CN9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GCC1Q96CN9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
GCC1Q96CN9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GCC1Q96CN9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GCC1Q96CN9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GCC1Q96CN9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
GCC1Q96CN9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GCC1Q96CN9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GCC1Q96CN9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GCC1Q96CN9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GCC1Q96CN9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GCC1Q96CN9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GCC1Q96CN9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GCC1Q96CN9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GCC1Q96CN9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GCC1Q96CN9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
GCC1Q96CN9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
GCC1Q96CN9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
GCC1Q96CN9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GCC1Q96CN9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GCC1Q96CN9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GCC1Q96CN9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 277.5 ms