Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EME1Q96AY2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EME1Q96AY2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EME1Q96AY2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms